跳到正文
SemantaSemanta文档

选择工作流节点

认识结构、缺陷、DFT、分子动力学及输出节点。

更新日期

在节点库中选择步骤

在材料计算专家中打开目标工作流,点击画布中的添加节点,通过搜索框查找节点,或按分类浏览。节点库也提供工具和模板入口;具体可选内容以当前列表为准。

选择节点时,先判断它需要什么输入、会产生什么输出,以及能否接在已有步骤之后。添加后点击节点说明查看用途,再配置必填参数。

输入、结构与输出

节点用途配置重点
用户输入定义本次运行需要填写的内容类型、默认值、必填项与文件限制
结构输入提供计算使用的结构结构内容、文件格式、元素和坐标
结构准备准备或标准化晶胞是否保留原晶胞及所选准备方式
结构变换生成超胞等结构变换变换方式、倍数及上游结构
输出汇总工作流需要返回的内容每个输出字段的来源

首次使用,建议从硅结构预处理开始。该任务便于同时核对结构、原子数和文件输出。

缺陷与 DFT 相关节点

节点库包含缺陷构建、缺陷分析,以及结构优化、单点能、磁性计算、非自洽计算、K 点设定、能带分析和态密度分析等步骤。

需要计算某项性质时,先确定它依赖的结构和上游结果。例如,分析节点应接收它所需的计算结果,不能只因名称相近就接到任意结构节点之后。选中节点后核对输入端口、计算设置和输出字段。

声子和热输运相关节点包括二阶力常数、三阶力常数、声子色散、晶格热导率和 MLIP 晶格热导率。选择路线时,需要明确模型、输入和计算规模;可以先让计算助手解释当前可用步骤及依赖关系。

分子动力学与分析节点

分子动力学分类提供力场推荐、体系准备、能量最小化、分子动力学,以及 RDF/配位数、MSD/扩散和热力学分析、结果报告等节点。

配置时重点区分三个阶段:准备体系与模型、执行计算、读取轨迹或结果做分析。对已有轨迹进行分析前,确认相应输入和采样条件已经提供。

可添加不等于可执行

节点库中的状态用于提示当前可用范围。标为执行待接入的主动学习闭环不能当作已可运行的计算步骤。已达到数量限制的节点可能不可重复添加。

搭建后使用检查验证配置和引用,再查看运行记录判断实际执行结果。节点类别不是一套固定计算配方;具体方法和条件应根据研究任务确定。

接下来可阅读输入与变量以及检查与运行。